第二集中，即合尼奥（基努·里维斯 Keanu Reeves 饰）没有能从内部摧毁“母体”，即合他的身体在真实世界的飞船上陷于昏迷，思想却被困在介于“母体”和真实世界的中间地带，这个地方由“火车人”控制。墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 Laurence Fishburne 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）等人知道了尼奥的情况，在守护天使的带领下， 找到了“火车人”的控制者梅罗纹奇，经过一番激斗，将尼奥救了出来。此时，电子乌贼部队对锡安发起了猛烈的攻击，人类组织所有机甲战士展开顽强的抵抗，形势危在旦夕；尼奥和崔妮蒂驾驶了一艘飞船克服重重困难，到达机器城市，尼奥终于见到了机器世界的统治者“机器大帝”，双方谈判并达成了协议：尼奥除掉不受“母体”控制的史密斯，以换取锡安的和平。在“母体”中，尼奥和史密斯展开了关系人类生死存亡的最后决斗。©豆瓣
回复 :因为痴迷基因再生和着迷于醒梦现象，里斯博士（乔纳森·莱斯·梅耶斯JonathanRhysMeyers饰）探索了年轻男子加布里埃尔·豪沃思（凯姆·吉甘戴CamGigandet饰）的心理。当暴力的梦境与现实融为一体时，加布里埃尔的生活发生了天翻地覆的变化。当加布里埃尔的梦折射出政治暗杀时，他必须争分夺秒地拯救自己和妻子布丽因（布兰妮·肖BrittanyShaw饰）的性命并阻止政府试验性计划。随着时间的流逝，加布里埃尔命悬一线，只有里斯博士能揭开这一切的真相。
回复 :
回复 :路易斯（欧文·瓦卡罗 Owen Vaccaro 饰）的父母在一场可怕的事故中双双离他而去，无依无靠的路易斯只得收拾行囊投奔他多年未见的舅舅乔纳森（杰克·布莱克 Jack Black 饰）。让路易斯没有想到的是，看上去平平无奇的乔纳森，他的真实身份竟然是一位拥有强大法力的魔法师。就这样，路易斯在舅舅那栋到处都发生着超自然现象的屋子里安了家，并且结识了舅舅的好友齐默尔曼夫人（凯特·布兰切特 Cate Blanchett 饰）。屋子里总有一种奇怪的嘀嗒声，乔纳森和齐默尔曼夫人企图找到这种声音的源头却无果，而这一切的始作俑者，是邪恶的黑魔法夫妻艾萨克（凯尔·麦克拉克伦 Kyle MacLachlan 饰）和赛琳娜（芮妮·戈兹贝里 Renee Goldsberry 饰）。
