千年一次的彗星之夜里，兄弟愿望将会实现……立志成为出色的神奇宝贝训练师的小智、兄弟小遥和小胜，带着皮卡丘展开了新的旅程。为了观看千年彗星出现的刹那，来到恩斯游乐场，并认识魔术师巴特勒与戴安。在魔术表演中，小胜听到一阵细微的呼唤声…那是在〝沉眠之茧〞中沉睡了千年，可帮助人类达成愿望的神奇宝贝——基拉祈。在千年彗星出现的夜晚，如果遇到拥有纯真心灵的伙伴便会苏醒。为了让基拉祈醒来，巴特勒请小胜当基拉祈的伙伴，果然，基拉祈从万花镜般的光芒中苏醒过来。虽然基拉祈只能停留短暂的七日就会再消失，但是头一次拥有属于自己的神奇宝贝的小胜，对基拉祈却非常宠爱。充满野心的魔术师巴特勒，因为知道基拉祈具有神奇的力量，便把基拉祈给抢走，并且想利用他来完成愿望。不怀好意的巴特勒，他的愿望是什么呢？小智与小胜要如何克服困难，成功救出同伴呢？小胜与基拉祈又会面临怎样的生离死别呢？
回复 :艾利欧从英国回来看望小樱，斯比也跟随而来。很久没见面的小可请不能吃甜食的斯比吃章鱼烧。斯比很喜欢章鱼烧，但是两人却为最后一个章鱼烧大打出手，结果章鱼烧飞出窗外，一场有趣的章鱼烧争夺赛便展开了。
回复 :萧炎得知异火线索后毅然深入塔戈尔沙漠，最终成功取得异火并与蛇人族女王美杜莎结下奇缘。随后萧炎勇赴三年之约，登上云岚宗击败纳兰嫣然一血前耻！不料异况突生，萧炎被人陷害被迫与云岚宗为敌，因此惨遭通缉不得不远赴迦南学院避难。萧炎在学院内与薰儿久别重逢，两人合力通过选拔进入内院，开始了全新的学习生活……
回复 :顺利通过期末测试的聂离，进入天才班的同时收获了肖凝儿的红玉。在学期结束时，回到天痕世家，恰逢黑暗公会来犯。聂离以一己之力击退执事李云华，却在家族会议上被长老刁难。所幸杨欣到场替聂离解围，于是聂离乘机将神圣世家和黑暗公会暗中勾结的秘密传达了给炼丹师协会。借助从拍卖会上买下的梦魇妖壶，聂离专注炼制妖灵，虎牙熊猫就此诞生。随后趁势参加神圣世家举办天才战，并与神圣世家长老沈冥立下赌约。虎牙熊猫技压全场，连胜沈飞，沈宁，沈啸三人，一鸣惊人。作为优胜，聂离名正言顺入住城主府，离叶紫芸更近一步。进入城主府中的天生幻境，聂离和萧凝儿一同遇见了幻境中的叶延始祖。被聂离的才学折服的叶延始祖，又目睹聂离收服镇压在幻境中的天陨神雷剑，于是自愿被聂离制作成为灵傀。离开城主府，聂离陆飘等人遭遇黑暗公会埋伏，却趁势将李云华和沈冥一网打尽。事件告一段落，聂离接到了叶修委托，着手建造万魔妖灵大阵。
