突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，轻音世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，轻音却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。世界的命运托付在了一位年仅14岁的少年身上，而“第二次冲击”所隐藏的“人类补完计划”似乎也开始了行动。掌握一切答案的碇元渡，却只是不动生色地观察，仿佛一切早已写入剧本。
回复 :故事以位于关东的某所小学为舞台，主要描写以该学校的6年2班中的CP——绫濑花日和高尾优斗、苍井结衣和桧山一翔的学校生活为中心展开的只属于12岁的淡淡的恋情与友情。
回复 :第1集 追逐幻影全球范围的追逐行动导致一场大追捕，而何方小姐获得在总部举行派对的奖励，但庆祝活动可能不会持续太久。第2集 护卫队福特西努力将何方小姐和特工飞车手带到安全的地方。既然情报局已经盯上了他们所有人，是时候采取行动了。第3集 逃犯逃亡的队员们面临资金短缺的问题，于是他们用自己最擅长的赛车来赚钱，以支持他们到达墨西哥城。第4集 莫拉伊失窃的文物让何方小姐和特工飞车手得知有可能是谁陷害了他们，于是他们搅乱了墨西哥城的一场化妆舞会。第5集 野豹猫王对蝴蝶勇士何方小姐和艾可应对回文，西斯哥在摔角馆找到了图科。莱拉告诉福特西她觉得自己在团队中不受欢迎。第6集 围攻相关部门步步紧逼，但队员们被困在上车中亟需援助，他们可能要将希望寄托在一个新成员身上。第7集 走入迷宫为了阻止莫拉伊的烈焰火山机摧毁墨西哥城，特工飞车手再次与时间赛跑。第8集 不要去追熔岩瀑布在城市地下充满熔岩的隧道深处，为了彻底粉碎莫拉伊的邪恶计划，特工飞车手与其展开最后决战。
意淋
回复 :剧情紧接外传 Battlefield of Pacifist（和平主义者的战场），地球与殖民地的战斗于殖民后196年结束。除五飞外，希洛等四位高达驾驶员决心把高达送往太阳丢弃，然而统一的地球圈再次被人类的欲望所吞噬，战乱再一次燃起。巴顿财团利用前OZ统帅杜鲁斯之女作傀儡领袖成立军队，以新建之殖民地X18999为基地，同时胁持担任地球外交官的莉莉娜作人质，企图实行第二次流星作战。希洛等人进入殖民地化解危机并把高达取回作战。
